MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cronobacter sakazakii ATCC BAA-894 chromosome

Total Repeats: 91231

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009778	ATC	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156932230
2	NC_009778	GATC	2	8	390	397	25 %	25 %	25 %	25 %	156932230
3	NC_009778	TCG	2	6	413	418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932230
4	NC_009778	CG	4	8	519	526	0 %	0 %	50 %	50 %	156932230
5	NC_009778	A	6	6	702	707	100 %	0 %	0 %	0 %	156932231
6	NC_009778	GAA	2	6	732	737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156932231
7	NC_009778	ACG	2	6	808	813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156932231
8	NC_009778	A	6	6	846	851	100 %	0 %	0 %	0 %	156932231
9	NC_009778	GAA	2	6	945	950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156932231
10	NC_009778	A	6	6	996	1001	100 %	0 %	0 %	0 %	156932231
11	NC_009778	TAAAGG	2	12	1022	1033	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	156932231
12	NC_009778	AACG	2	8	1182	1189	50 %	0 %	25 %	25 %	156932231
13	NC_009778	GTA	2	6	1212	1217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156932231
14	NC_009778	CTG	3	9	1239	1247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932231
15	NC_009778	GAG	2	6	1312	1317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156932231
16	NC_009778	GC	3	6	1352	1357	0 %	0 %	50 %	50 %	156932233
17	NC_009778	AGA	2	6	1460	1465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156932233
18	NC_009778	A	6	6	1492	1497	100 %	0 %	0 %	0 %	156932233
19	NC_009778	TGG	2	6	1563	1568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156932233
20	NC_009778	GC	3	6	1631	1636	0 %	0 %	50 %	50 %	156932233
21	NC_009778	GCT	2	6	1719	1724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932233
22	NC_009778	ATC	2	6	1765	1770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156932233
23	NC_009778	CTG	2	6	1889	1894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932233
24	NC_009778	GAG	2	6	1912	1917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156932233
25	NC_009778	GAA	2	6	1935	1940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156932234
26	NC_009778	CTG	2	6	1944	1949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932234
27	NC_009778	TGC	2	6	1954	1959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932234
28	NC_009778	GC	3	6	1958	1963	0 %	0 %	50 %	50 %	156932234
29	NC_009778	A	6	6	1999	2004	100 %	0 %	0 %	0 %	156932234
30	NC_009778	GCT	2	6	2058	2063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932234
31	NC_009778	GAAGTC	3	18	2079	2096	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	156932234
32	NC_009778	GTC	2	6	2149	2154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932234
33	NC_009778	A	6	6	2166	2171	100 %	0 %	0 %	0 %	156932234
34	NC_009778	AAG	2	6	2188	2193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156932234
35	NC_009778	CGG	2	6	2213	2218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156932234
36	NC_009778	A	7	7	2349	2355	100 %	0 %	0 %	0 %	156932236
37	NC_009778	GGT	2	6	2366	2371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156932236
38	NC_009778	AAC	2	6	2375	2380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156932236
39	NC_009778	CAC	2	6	2392	2397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156932236
40	NC_009778	GGT	3	9	2408	2416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156932236
41	NC_009778	TTG	2	6	2436	2441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156932236
42	NC_009778	CAA	2	6	2452	2457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156932236
43	NC_009778	GTT	2	6	2474	2479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156932236
44	NC_009778	TGC	2	6	2608	2613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932236
45	NC_009778	GGTT	2	8	2653	2660	0 %	50 %	50 %	0 %	156932236
46	NC_009778	CTG	2	6	2715	2720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932236
47	NC_009778	CTGCGT	2	12	2765	2776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932236
48	NC_009778	CG	3	6	2810	2815	0 %	0 %	50 %	50 %	156932236
49	NC_009778	TGC	2	6	2847	2852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932236
50	NC_009778	TGC	2	6	2872	2877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932236
51	NC_009778	GTG	2	6	2886	2891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156932236
52	NC_009778	TGG	3	9	2941	2949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156932236
53	NC_009778	AAG	2	6	3008	3013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156932236
54	NC_009778	GCA	2	6	3018	3023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156932236
55	NC_009778	AAT	2	6	3063	3068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156932236
56	NC_009778	TC	3	6	3093	3098	0 %	50 %	0 %	50 %	156932237
57	NC_009778	GAA	2	6	3131	3136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156932237
58	NC_009778	AAG	2	6	3165	3170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156932237
59	NC_009778	CGT	2	6	3189	3194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932237
60	NC_009778	GTC	2	6	3244	3249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932237
61	NC_009778	CGA	2	6	3272	3277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156932237
62	NC_009778	GGTC	2	8	3281	3288	0 %	25 %	50 %	25 %	156932237
63	NC_009778	A	6	6	3342	3347	100 %	0 %	0 %	0 %	156932237
64	NC_009778	AAG	2	6	3351	3356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156932237
65	NC_009778	TTC	2	6	3408	3413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156932239
66	NC_009778	TGG	2	6	3431	3436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156932239
67	NC_009778	CGT	2	6	4101	4106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932240
68	NC_009778	CGT	2	6	4116	4121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932240
69	NC_009778	GCG	2	6	4198	4203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156932240
70	NC_009778	GC	3	6	4259	4264	0 %	0 %	50 %	50 %	156932240
71	NC_009778	ACA	2	6	4276	4281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156932240
72	NC_009778	CAC	2	6	4295	4300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156932240
73	NC_009778	TGG	2	6	4349	4354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156932240
74	NC_009778	GCT	2	6	4359	4364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932240
75	NC_009778	AAC	2	6	4369	4374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156932240
76	NC_009778	GCT	2	6	4386	4391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932240
77	NC_009778	AGC	3	9	4402	4410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156932240
78	NC_009778	GTAAAG	2	12	4686	4697	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	156932241
79	NC_009778	GCA	2	6	4796	4801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156932241
80	NC_009778	ACC	2	6	4820	4825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156932241
81	NC_009778	GCT	2	6	4899	4904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932242
82	NC_009778	CTG	2	6	4909	4914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932242
83	NC_009778	CGT	2	6	4987	4992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932242
84	NC_009778	ACTG	2	8	5016	5023	25 %	25 %	25 %	25 %	156932242
85	NC_009778	GTT	2	6	5073	5078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156932243
86	NC_009778	TTG	3	9	5101	5109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156932243
87	NC_009778	AAC	2	6	5187	5192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156932243
88	NC_009778	GC	3	6	5503	5508	0 %	0 %	50 %	50 %	156932244
89	NC_009778	ATC	2	6	5571	5576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156932244
90	NC_009778	CG	3	6	5602	5607	0 %	0 %	50 %	50 %	156932244
91	NC_009778	A	6	6	5616	5621	100 %	0 %	0 %	0 %	156932244
92	NC_009778	GTG	2	6	5643	5648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156932244
93	NC_009778	AAG	2	6	5655	5660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156932244
94	NC_009778	TCG	2	6	5666	5671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932244
95	NC_009778	TTC	2	6	5713	5718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156932244
96	NC_009778	AAC	3	9	5721	5729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156932244
97	NC_009778	AGC	2	6	5734	5739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156932244
98	NC_009778	ATC	2	6	5802	5807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156932244
99	NC_009778	TC	3	6	5806	5811	0 %	50 %	0 %	50 %	156932244
100	NC_009778	CGT	2	6	5857	5862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932245
101	NC_009778	GTAAA	2	10	5909	5918	60 %	20 %	20 %	0 %	156932245
102	NC_009778	A	6	6	5916	5921	100 %	0 %	0 %	0 %	156932245
103	NC_009778	TTG	2	6	5945	5950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156932245
104	NC_009778	AACC	2	8	5998	6005	50 %	0 %	0 %	50 %	156932245
105	NC_009778	GCT	2	6	6028	6033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932245
106	NC_009778	A	6	6	6112	6117	100 %	0 %	0 %	0 %	156932245
107	NC_009778	TTC	2	6	6124	6129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156932245
108	NC_009778	TAC	2	6	6189	6194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156932247
109	NC_009778	AGT	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156932247
110	NC_009778	A	6	6	6210	6215	100 %	0 %	0 %	0 %	156932247
111	NC_009778	TGA	2	6	6217	6222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156932247
112	NC_009778	CTG	2	6	6315	6320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932247
113	NC_009778	GCA	2	6	6327	6332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156932247
114	NC_009778	GCA	2	6	6342	6347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156932247
115	NC_009778	ATC	2	6	6576	6581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156932247
116	NC_009778	ATTACC	2	12	6630	6641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156932247
117	NC_009778	ACT	2	6	6642	6647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156932247
118	NC_009778	TGA	2	6	6656	6661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156932247
119	NC_009778	CTG	2	6	6675	6680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932247
120	NC_009778	CAAT	2	8	6734	6741	50 %	25 %	0 %	25 %	156932248
121	NC_009778	CTGAA	2	10	6798	6807	40 %	20 %	20 %	20 %	156932248
122	NC_009778	CGA	2	6	6835	6840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156932248
123	NC_009778	GTC	2	6	6927	6932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932248
124	NC_009778	TCC	2	6	7148	7153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156932249
125	NC_009778	GAAG	2	8	7183	7190	50 %	0 %	50 %	0 %	156932249
126	NC_009778	GGAACT	2	12	7234	7245	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	156932249
127	NC_009778	TGT	2	6	7273	7278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156932249
128	NC_009778	GCC	2	6	7299	7304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156932249
129	NC_009778	A	6	6	7325	7330	100 %	0 %	0 %	0 %	156932249
130	NC_009778	GGCC	2	8	7351	7358	0 %	0 %	50 %	50 %	156932249
131	NC_009778	GC	3	6	7409	7414	0 %	0 %	50 %	50 %	156932249
132	NC_009778	TGG	2	6	7426	7431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156932249
133	NC_009778	A	6	6	7464	7469	100 %	0 %	0 %	0 %	156932250
134	NC_009778	CG	3	6	7669	7674	0 %	0 %	50 %	50 %	156932250
135	NC_009778	CTG	2	6	7679	7684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932250
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137	NC_009778	TGGT	2	8	7734	7741	0 %	50 %	50 %	0 %	156932250
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142	NC_009778	GC	3	6	7912	7917	0 %	0 %	50 %	50 %	156932250
143	NC_009778	CGT	2	6	7922	7927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932250
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147	NC_009778	TGG	2	6	8088	8093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156932252
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149	NC_009778	TGC	2	6	8224	8229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932252
150	NC_009778	GC	4	8	8251	8258	0 %	0 %	50 %	50 %	156932252
151	NC_009778	TGC	2	6	8335	8340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932252
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158	NC_009778	GC	3	6	8712	8717	0 %	0 %	50 %	50 %	156932253
159	NC_009778	TGGCC	2	10	8805	8814	0 %	20 %	40 %	40 %	156932253
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164	NC_009778	CTG	2	6	9011	9016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156932254
165	NC_009778	GAG	2	6	9058	9063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156932254
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246	NC_009778	CGATC	2	10	13323	13332	20 %	20 %	20 %	40 %	156932260
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250	NC_009778	GTCT	2	8	13508	13515	0 %	50 %	25 %	25 %	156932260
251	NC_009778	ATC	2	6	13703	13708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156932261
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256	NC_009778	AAGCAG	2	12	13971	13982	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	156932261
257	NC_009778	TGT	2	6	14040	14045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156932262
258	NC_009778	TTC	2	6	14078	14083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156932262
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